一、采购项目名称及内容
采购人：广西壮族自治区疾病预防控制中心；
采购项目名称：免疫规划检测项目测序服务；
项目编号：--（重）；
资金来源：财政资金。
二、项目内容
（一）菌株全基因组测序：次。
．样本类型：纯化后的灭活细菌。
．提取：采用或的方法对样本的基因组 进行提取，之后利用琼脂糖凝胶电泳检测 的纯度和完整性，利用进行定量。
．文库构建： 经电泳检测合格的 样品用 超声波破碎仪随机打断成长度约为的片段。处理完成后的片段，使用 ®™ (, )试剂盒，经末端修复、加尾、加测序接头、纯化、扩增等步骤完成整个文库制备。
．文库检测：文库构建完成后，先使用 . 进行初步定量，稀释文库至 /，使用 对文库的插入片段进行检测， 符合预期后，使用 - 方法对文库的有效浓度进行准确定量，以保证文库质量。
．测序和交付平台：使用 上机测序，运行智能化交付系统和自动化样本库系统；
．数据质量：原始下机数据测序质量要求: ≥%，≥%；
．数据量： ≥/样本；
．数据交付：需要交付 ；
．周期要求：需要保证项目可加急得到响应，二代测序仪充足≥台；
．生物信息学分析内容：
① 原始下机数据处理:过滤测序质量值低的，保留高质量，得到 ；
② 样品组装: 进行基因组组装，得到能反映样品基因组基本情况的序列文件，并对组装结果进行评价；
③ 基因组组分分析 组装完成后，分析样品基因组的成分，包括编码基因、非编码、重复序列、前噬菌体、基因岛、等基因组成分的预测；
④ 功能注释 针对编码基因序列进行不同数据库的功能注释，包括常用的、数据库、针对病原微生物的数据库；
⑤ 基因组比较分析 此步骤从基因组、基因两层面分别比较样品与参考基因组的差异，包括共线性分析、基因家族构建、共有/特有基因分析、物种进化树构建。
（二）一代测定服务：....
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